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ncbi简介

NCBI代表美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information），是美国国立卫生研究院（NIH）下属的一个部门。NCBI是一个重要的生物信息学资源中心，旨在收集、存储和分发生物学和生物医学领域的大量数据和信息。

ncbi官网: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/

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ncbi

NCBI的主要任务是提供广泛的生物信息学工具和数据库，以支持科学研究、生物医学研究和基因组学等领域的发展。

它提供了许多重要的数据库和工具，如以下几个：

1. PubMed：生物医学文献数据库，收录了全球生物医学文献的摘要和全文。

2. GenBank：全球最大的核酸序列数据库，包含各种生物体的DNA和RNA序列。

3. BLAST：生物信息学工具，用于比对和匹配DNA、RNA和蛋白质序列。

4. PubChem：化学物质数据库，提供了大量化合物的结构、属性和生物活性信息。

5. GEO：基因表达数据库，存储了全球各种生物体的基因表达数据。

此外，NCBI还提供了许多其他数据库和工具，如dbSNP（单核苷酸多态性数据库）、ClinVar（临床相关变异数据库）等，用于研究基因组学、遗传学、生物信息学等领域。

总的来说，NCBI是一个重要的生物信息学资源中心，为科学研究人员、医学专业人士和生物信息学家提供了丰富的数据和工具，促进了生物学和生物医学研究的发展。如需了解更多详细信息，建议访问NCBI官方网站或参考相关资料。

非常有用且便捷的数据库一——NCBI

NCBI，美国国家医学图书馆(NLM)的一部分(该图书馆是美国国家卫生研究所的一部分)。NCBI数据库由Nucleotide（核苷酸序列数据库）、 Genome（基因组数据库）、Structure（结构数据库或称分子模型数据库）、Taxonomy（生物学门类数据库）、 PopSet几个子库组成。
常用功能：
1）查询某个基因功能、分布、序列等。在 search 后面选择 Gene，输入需要查找的基因的名字，点击search，查看结果。
2）primer-BLAST（/tools/primer-blast/）在设计出引物之后还在某些相应数据库中进行BLAST搜索，因此可以得到特异性引物，扩增出目的片段。用户在给出DNA模板的同时还可以限定正向引物或反向引物，这样，NCBI就只会给出另一条引物。如果用户给出了模板DNA和两条引物序列，Primer-BLAST就只会运行BLAST程序，帮助用户对引物进行分析。用户也可以只给出两条引物而不给出模板序列，这时Primer-BLAST会通过BLAST程序分析出与这对引物最匹配的模板序列。Primer-BLAST进行BLAST搜索的数据库包括RefSeq mRNA、BLAST nr和12种模式生物基因组数据库。
3）Entrez。Entrez数据库是一个整合了多个数据库的综合检索系统，它包含了35个不同数据库的信息，共收录有超过350,000,000条记录(表1)。Entrez数据库支持使用简单的布尔查询(Boolean queries)方式进行文本搜索，可以下载不同格式的数据资料，还可以按照生物学关系提供与其它相关记录的链接。这些链接给出的都是最简要的信息，例如会给出一条序列和报道该序列的论文摘要，或者会给出一条蛋白质序列的编码DNA序列或该蛋白质的3D结构图。这种通过计算机运算，即基于比较序列相似性或PubMed中摘要的相似性，所给出的相关链接信息可以以最快的速度提供给用户大量的相关信息。还有一种叫做“LinkOut”的功能将这种链接功能扩展到了与外部数据库，例如各物种基因组数据库之间的链接。Entrez中搜索到的数据可以以多种格式输出，也可以打包下载或逐个下载。

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✅干货｜目前最全的医学文献数据库了

1️⃣Pubmed
Pubmed是美国国家医学图书馆（NLM）所属的国家生物技术信息中心（NCBI）于2000年4月开发的一个基于WEB的生物医学信息检索系统。它是NCBI Entrez整个数据库查询系统中的一个。
🟢其数据主要来源有：MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等
🟣数据类型：期刊论文、综述、以及与其它数据库。
🌟优点：Pubmed是免费提供生物医学方面的论文搜寻引擎2️⃣Embase
Embase（Excerpt Medica Database）是由荷兰出版大佬Elsevier Science公司建立的EM的书目型数据库。内容涉及药学、临床医学、基础医学、预防医学、法医学和生物医学工程等。
除了可以检索丰富的医学文献外，还支持药物和疾病检索。

3️⃣OVID
4️⃣ Cochrane library
5️⃣ Clinicalkey
6️⃣MEDLINE
7️⃣Scopus
8️⃣UpTodate
9️⃣JAMA
🔟中国知网
1️⃣1️⃣万方数据库（中华医学）
1️⃣2️⃣中国生物医学文献数据库（SinoMed）

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强推❗医生最常用的医学网站

一、Pubmed
pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
Pubmed是美国国家医学图书馆（NLM）所属的国家生物技术信息中心（NCBI）于2000年4月开发的一个基于WEB的生物医学信息检索系统。它是NCBI Entrez整个数据库查询系统中的一个。其数据主要来源有：MEDLINE、OLDMEDLINE、Record in process、Record supplied by publisher等。
二、EMBASE
embase.com
内容涉及药学、临床医学、基础医学、预防医学、法医学和生物医学工程等。除了可以检索丰富的医学文献外，还支持药物和疾病检索。
三、Cochrane libra
cochranelibrary.com
Cochrane library（考克兰图书馆）是the Cochrane Collaboration的主要产品，目前是John Wiley & Sons国际出版社负责出版。
它包含以下6个数据库 ?
1.Cochrane Database of Systematic Review（医学保健领域系统评估的领先资源）
2.Cochrane 临床对照实验数据库
3.Cochrane Methodology Register（介绍进行对照试验时所用方法的参考出版物）
4.Health Technology Assessment Database（卫生技术评估）
四、ClinicalKey
clinicalkey.com
临床精钥是信息分析公司爱思唯尔（Elsevier）推出的一个临床决策支持工具，帮助医生快速获取准确、简洁、世界前沿的循证医学知识。临床精钥包含了经本地专家参与审阅编辑的基于最新证据及实践指南的临床综述，并收录了如Braunwald’s心脏病、罗森急诊医学等经典图书，涵盖超过25000种中国临床用药信息，并有400多种医学评分工具等
五、Clinical trials
ClinicalTrials.gov
Clinical trials（美国临床试验数据库）是美国国立医学图书馆（NML）与美国食品与药物管理局（FDA）在1997年开发的数据库。里面提供了网站临床试验注册辅导，登记了各种观察性研究和干预性研究，包括药物、器械和手术等干预方式。其注册和查询临床试验均为免费

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