Flowjo

Flowjo官网,数据可视化,流式细胞数据

Flowjo是什么

FlowJo 是一款流式细胞仪数据分析软件，它被广泛用于对流式细胞仪生成的数据进行处理、可视化和解释。FlowJo 的主要功能包括数据清洗、流程分析、数据可视化、种群比较和统计分析等。用户可以通过 FlowJo 对细胞表型、功能和亚群进行分析，并生成高质量的图形和报告。FlowJo 提供了强大的数据分析工具、多种图表和图像选项、自定义的数据筛选和控制、高级统计方法等功能。同时，FlowJo 还支持插件扩展，以满足不同用户的需求。该软件在生命科学研究领域，特别是免疫学、细胞生物学和临床研究中得到了广泛应用。FlowJo 不仅适用于单个样本的数据分析，还能处理多重样本、复杂的实验设计和大规模数据集。它提供了直观友好的界面，使用户能够方便地导入、管理和分析流式细胞仪数据。需要注意的是，FlowJo 是一个商业软件，用户需要购买许可证才能使用其完整功能。

Flowjo官网：https://www.flowjo.com/

Flowjo单荧光流式结果分析与作图

1.首先打开FlowJo软件，并将流式结果拉进打开的对话框（p2）
2.选中结果双击，对其进行坐标参数设置（p3）
3.点击T还可以对坐标数值进行调节（p4）
4.以空白组为基准设置线型门（p5）
5加入layout editor进行作图（p6）
6.刚加入时每组会在同一位置，将他们分开查看，要做叠加图的话，就可以再把它们拽到第一组上层，出现蓝框后，松开就可以叠加（p6）
7.图片的叠加形式可以通过右键点击图片来进行选择（p7）
8.获得四种不同形式图（p8）

Flowjo分析细胞周期

细胞周期是指以有丝分裂方式增殖的细胞从亲代分裂结束到子细胞分裂结束所经历的过程。通常由G0/G1期、S期、G2期和M期组成。G1期：细胞开始RNA和蛋白质的合成，但DNA含量仍保持二倍体。S期：DNA开始合成，这时细胞核内DNA的含量介于G1期和G2期之间。当DNA复制结束成为4倍体时，细胞进入G2期。G2期的细胞继续合成RNA及蛋白质，直到进入M期。因此，单纯从DNA含量无法区分G2期和M期。一旦有丝分裂发生，细胞分裂成两个细胞，这两个细胞或者进入下一个细胞周期，或者进入静止期（G0期），而G0期从DNA含量上同样无法与G1期区分。因此，整个复制周期可以描述为G0/G1、S、G2/M期。通过核酸染料PI标记DNA,并由流式细胞仪进行分析，可以得到细胞各个时期的分布状态，计算出G0/G1%、S%、G2/M%，了解增殖能力，在肿瘤病理学研究中，通常以S期细胞比率作为判断肿瘤增殖状态的指标。
细胞周期检测的原理：
核酸染料可以与DNA分子特异性的结合，细胞周期检测中PI最为常用。PI为插入性核酸荧光染料，能选择性的嵌入核酸DNA和RNA双链螺旋的碱基之间与之结合，其结合的量与DNA的含量成正比例关系，用流式细胞仪进行分析，就可以得到细胞周
FlowJo分析细胞周期教程
首先在我们的电脑上安装FlowJo X（需要安装软件请关注微信号，留言回复“软件”索取）
打开上图的第二个图标，直接拖入需要分析的流式周期fcs文件
双击打开要分析的文件，会出现以下界面。X轴选择FSC-A，Y轴选择SSC-A。请注意标红框的位置要选择Linear Axis。
在文件左上区域根据习惯选择一种圈门方式，圈出符合分析条件的细胞团
双击细胞团，进入一个新的界面。用方框的门圈出single cells。
返回主界面，右键single cells，选择cell cycle。
出现如下界面，单击OK。
进入结果分析界面，选择通道PE-A
然后就得到了彩色的周期图。
返回主界面，选择如下图标，将cell cycle直接拖入右边对话框，再储存成我们需要的文件格式。
如果需要批量分析的话，可以选中如下文件，直接鼠标拖入下一个文件中。导出文件时，也可以批量导出。